Le parc national marin de Sainte-Anne, établi en 1973, est devenu la première zone marine protégée de l'océan Indien — un sanctuaire de 14,43 kilomètres carrés abritant six îles granitiques et certains des récifs coralliens les mieux préservés des Seychelles.
Le parc se situe à quatre kilomètres de la côte est de Mahé, ses limites englobant des herbiers marins peu profonds, des tombants plongeant jusqu'à 50 mètres et des récifs frangeants où broutent des tortues imbriquées et où des bancs de vivaneaux stationnent dans la colonne d'eau intermédiaire. La taxe de conservation introduite en 1994 finance les patrouilles de gardes forestiers, l'entretien des bouées d'amarrage et les programmes de surveillance des récifs qui suivent les épisodes de blanchiment et les populations de poissons sur 29 sites d'étude permanents.
Les visites en semi-sous-marin aux Seychelles fonctionnent toute l'année, offrant un accès à sec à la topographie sous-marine du parc grâce à des fenêtres d'observation en acrylique situées à 1,5 mètre sous la ligne de flottaison. Les navires naviguent dans les zones récifales peu profondes où la visibilité atteint généralement 15 à 20 mètres, passant au-dessus de pâtés coralliens colonisés par du corail cerveau, des formations de corail corne de cerf et des gorgones molles. Les passagers restent dans des cabines climatisées tandis que la coque se déplace lentement au-dessus des herbiers où les tortues vertes se nourrissent et où les poissons-perroquets broutent les algues sur les rochers. L'itinéraire évite les zones sans ancrage du parc, en utilisant des chenaux désignés qui protègent le substrat sensible des dommages causés par les hélices.
Les six îles du parc — Sainte Anne, Cerf, Moyenne, Round, Long et Cachée — possèdent chacune des écologies terrestres et intertidales distinctes. L'île Moyenne, restaurée de manière privée depuis 1964, abrite des populations de tortues géantes d'Aldabra et le gardénia endémique de Wright. Round Island, autrefois une léproserie, accueille désormais des oiseaux marins nicheurs. La côte est de l'île au Cerf conserve des vestiges de plantations de cannelle de l'époque coloniale, leurs murs en pierre envahis par des vacoas et des badamiers. Les excursions en catamaran d'île en île combinent souvent l'observation des récifs en semi-submersible avec des arrêts sur les plages de Moyenne ou de Cerf, accostant sur du sable blanc issu de millénaires d'érosion par les poissons-perroquets — chaque poisson produit jusqu'à 90 kilogrammes de sable par an en broyant le corail en fins sédiments.
Le plan de gestion du parc restreint les sports nautiques motorisés et la pêche commerciale dans ses limites, maintenant des niveaux de biomasse de poissons 40 % plus élevés que sur les récifs non protégés voisins. Les safaris snorkeling partent quotidiennement de la marina d'Eden Island, ciblant des sites peu profonds près de Moyenne où les poissons-chirurgiens, les poissons-anges et les poissons-papillons se rassemblent autour des affleurements coralliens. Les itinéraires de safari récifal incluent des sessions guidées de snorkeling sur deux ou trois sites, avec des biologistes marins identifiant les espèces et expliquant les relations symbiotiques entre les labres nettoyeurs et les mérous, ou le rôle des concombres de mer dans le renouvellement des sédiments. La taxe de conservation de 200 roupies seychelloises par adulte finance la restauration continue de l'habitat, y compris les projets de pépinières de coraux qui cultivent des fragments pour une transplantation dans les zones dégradées.
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